MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 4207 chromosome

Total Repeats: 101777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016768	CGT	2	6	97	102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294202
2	NC_016768	CAC	2	6	128	133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294202
3	NC_016768	GTC	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294202
4	NC_016768	GAC	2	6	180	185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294202
5	NC_016768	CAG	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294202
6	NC_016768	TCG	2	6	268	273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294202
7	NC_016768	AGC	2	6	300	305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294202
8	NC_016768	GCC	2	6	361	366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294202
9	NC_016768	CCG	2	6	405	410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294202
10	NC_016768	CGAC	2	8	412	419	25 %	0 %	25 %	50 %	375294202
11	NC_016768	CGA	2	6	425	430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294202
12	NC_016768	GCC	2	6	440	445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294202
13	NC_016768	ACG	2	6	490	495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294202
14	NC_016768	TGA	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294202
15	NC_016768	CGTT	2	8	628	635	0 %	50 %	25 %	25 %	375294202
16	NC_016768	CGC	3	9	662	670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294202
17	NC_016768	CCCG	2	8	690	697	0 %	0 %	25 %	75 %	375294202
18	NC_016768	AC	3	6	744	749	50 %	0 %	0 %	50 %	375294202
19	NC_016768	GGCA	2	8	761	768	25 %	0 %	50 %	25 %	375294202
20	NC_016768	GTT	2	6	782	787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294202
21	NC_016768	CGA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294202
22	NC_016768	TTC	2	6	957	962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375294202
23	NC_016768	CAA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375294202
24	NC_016768	TCATC	2	10	1003	1012	20 %	40 %	0 %	40 %	375294202
25	NC_016768	CCCA	2	8	1019	1026	25 %	0 %	0 %	75 %	375294202
26	NC_016768	AGC	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294202
27	NC_016768	ACC	2	6	1094	1099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294202
28	NC_016768	CGA	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294202
29	NC_016768	CAG	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294202
30	NC_016768	GC	3	6	1222	1227	0 %	0 %	50 %	50 %	375294202
31	NC_016768	GCG	2	6	1338	1343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294202
32	NC_016768	CCG	2	6	1360	1365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294202
33	NC_016768	CA	3	6	1509	1514	50 %	0 %	0 %	50 %	375294202
34	NC_016768	CAC	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294202
35	NC_016768	CGTTT	2	10	2193	2202	0 %	60 %	20 %	20 %	375294203
36	NC_016768	GTGG	2	8	2233	2240	0 %	25 %	75 %	0 %	375294203
37	NC_016768	GCCA	2	8	2251	2258	25 %	0 %	25 %	50 %	375294203
38	NC_016768	CGGTGC	2	12	2265	2276	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	375294203
39	NC_016768	GTT	2	6	2287	2292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294203
40	NC_016768	CCG	2	6	2343	2348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294203
41	NC_016768	TTG	2	6	2405	2410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294203
42	NC_016768	CGA	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294203
43	NC_016768	TTG	2	6	2564	2569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294203
44	NC_016768	ATT	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375294203
45	NC_016768	TCAG	2	8	2595	2602	25 %	25 %	25 %	25 %	375294203
46	NC_016768	CGC	2	6	2611	2616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294203
47	NC_016768	GAC	2	6	2624	2629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294203
48	NC_016768	GGT	2	6	2677	2682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294203
49	NC_016768	CGT	2	6	2736	2741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294203
50	NC_016768	GCC	2	6	2792	2797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294203
51	NC_016768	CGG	2	6	2809	2814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294203
52	NC_016768	CGTT	2	8	2821	2828	0 %	50 %	25 %	25 %	375294203
53	NC_016768	GCA	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294203
54	NC_016768	CTT	2	6	2909	2914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375294203
55	NC_016768	AC	3	6	2956	2961	50 %	0 %	0 %	50 %	375294203
56	NC_016768	CCA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294203
57	NC_016768	GC	3	6	3033	3038	0 %	0 %	50 %	50 %	375294203
58	NC_016768	GAT	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294203
59	NC_016768	TTG	3	9	3117	3125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294203
60	NC_016768	ACGG	2	8	3173	3180	25 %	0 %	50 %	25 %	375294203
61	NC_016768	GCCT	2	8	3235	3242	0 %	25 %	25 %	50 %	375294203
62	NC_016768	CGG	2	6	3306	3311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294203
63	NC_016768	CGGTT	2	10	3342	3351	0 %	40 %	40 %	20 %	375294203
64	NC_016768	CGTC	2	8	3386	3393	0 %	25 %	25 %	50 %	375294204
65	NC_016768	TTG	2	6	3463	3468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294204
66	NC_016768	CGA	2	6	3517	3522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294204
67	NC_016768	GGTA	2	8	3566	3573	25 %	25 %	50 %	0 %	375294204
68	NC_016768	GTG	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294204
69	NC_016768	ACG	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294204
70	NC_016768	CAA	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375294204
71	NC_016768	ATC	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294204
72	NC_016768	TGT	2	6	3724	3729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294204
73	NC_016768	GGTT	2	8	3748	3755	0 %	50 %	50 %	0 %	375294204
74	NC_016768	CGG	2	6	3774	3779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294204
75	NC_016768	GAT	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294204
76	NC_016768	GT	3	6	3913	3918	0 %	50 %	50 %	0 %	375294204
77	NC_016768	TGG	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294204
78	NC_016768	CCGC	2	8	3976	3983	0 %	0 %	25 %	75 %	375294204
79	NC_016768	GAA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375294204
80	NC_016768	AGC	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294204
81	NC_016768	GGC	2	6	4145	4150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294204
82	NC_016768	GGC	2	6	4154	4159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294204
83	NC_016768	GAC	2	6	4212	4217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294204
84	NC_016768	GGC	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294204
85	NC_016768	TGG	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294204
86	NC_016768	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294204
87	NC_016768	CGA	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294204
88	NC_016768	CGG	2	6	4402	4407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294204
89	NC_016768	CCG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294204
90	NC_016768	CCG	2	6	4459	4464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294204
91	NC_016768	GGT	2	6	4523	4528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294204
92	NC_016768	TGC	3	9	4633	4641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294205
93	NC_016768	CG	5	10	4643	4652	0 %	0 %	50 %	50 %	375294205
94	NC_016768	GTCGG	2	10	4690	4699	0 %	20 %	60 %	20 %	375294205
95	NC_016768	CGA	2	6	4712	4717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294205
96	NC_016768	GGT	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294205
97	NC_016768	CCA	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294205
98	NC_016768	ACG	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294205
99	NC_016768	CGC	2	6	4978	4983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294205
100	NC_016768	CGG	2	6	5028	5033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294205
101	NC_016768	CG	3	6	5079	5084	0 %	0 %	50 %	50 %	375294205
102	NC_016768	AGA	2	6	5242	5247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375294206
103	NC_016768	GTG	2	6	5275	5280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294206
104	NC_016768	GCG	2	6	5292	5297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294206
105	NC_016768	GAG	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375294206
106	NC_016768	AAG	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375294206
107	NC_016768	GGT	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294206
108	NC_016768	CGA	2	6	5502	5507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294206
109	NC_016768	TGC	2	6	5543	5548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294206
110	NC_016768	CGA	2	6	5574	5579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294206
111	NC_016768	CCAC	2	8	5600	5607	25 %	0 %	0 %	75 %	375294206
112	NC_016768	ACCG	2	8	5619	5626	25 %	0 %	25 %	50 %	375294206
113	NC_016768	GTG	2	6	5632	5637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294206
114	NC_016768	CGG	2	6	5655	5660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294206
115	NC_016768	TGG	2	6	5691	5696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294206
116	NC_016768	CGGCGT	2	12	5703	5714	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	375294206
117	NC_016768	GGT	2	6	5718	5723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294206
118	NC_016768	CAAG	2	8	5814	5821	50 %	0 %	25 %	25 %	375294206
119	NC_016768	AAG	2	6	5833	5838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375294206
120	NC_016768	CGCC	2	8	5910	5917	0 %	0 %	25 %	75 %	375294206
121	NC_016768	CAA	2	6	5940	5945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375294206
122	NC_016768	CGA	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294206
123	NC_016768	GTC	2	6	5992	5997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294206
124	NC_016768	TGG	2	6	6110	6115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294206
125	NC_016768	AGC	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294206
126	NC_016768	GGC	2	6	6277	6282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294206
127	NC_016768	GC	3	6	6305	6310	0 %	0 %	50 %	50 %	375294206
128	NC_016768	GGT	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294206
129	NC_016768	AAGGAC	2	12	6355	6366	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	375294206
130	NC_016768	AGACCA	2	12	6449	6460	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	375294206
131	NC_016768	GCG	2	6	6621	6626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294206
132	NC_016768	CGGC	2	8	6725	6732	0 %	0 %	50 %	50 %	375294206
133	NC_016768	ATC	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294206
134	NC_016768	GC	3	6	6811	6816	0 %	0 %	50 %	50 %	375294206
135	NC_016768	ATC	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294206
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157	NC_016768	ACC	2	6	7653	7658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294207
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250	NC_016768	CTCA	2	8	12404	12411	25 %	25 %	0 %	50 %	375294209
251	NC_016768	ACG	2	6	12765	12770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294210
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256	NC_016768	CAG	2	6	13324	13329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294211
257	NC_016768	C	6	6	13330	13335	0 %	0 %	0 %	100 %	375294211
258	NC_016768	GGC	2	6	13368	13373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294211
259	NC_016768	TCG	2	6	13388	13393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294211
260	NC_016768	GAT	2	6	13399	13404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294211
261	NC_016768	AACC	2	8	13439	13446	50 %	0 %	0 %	50 %	375294211
262	NC_016768	GC	3	6	13490	13495	0 %	0 %	50 %	50 %	375294211
263	NC_016768	CCCG	2	8	13548	13555	0 %	0 %	25 %	75 %	375294211
264	NC_016768	TGC	2	6	13652	13657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294211
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270	NC_016768	GA	3	6	14227	14232	50 %	0 %	50 %	0 %	375294213
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272	NC_016768	GGCGT	2	10	14255	14264	0 %	20 %	60 %	20 %	375294213
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